К редким и исчезающим видам национального парка, занесенным в Красную книгу Республики Казахстан, относятся: 1 вид пресмыкающихся, 33 вида птиц и 6 видов млекопитающих, один из которых - тянь-шанский бурый медведь Ursus arctos isabellinus), хищник, относящийся к семейству Медвежьих. Его главный отличительный признак — длинные светлые когти на передних лапах.

Данному виду присвоен статус 3-й категории. Его численность и ареал обитания резко сокращаются из-за браконьерства, сокращения основных местообитаний этого зверя,  вытеснения его с территории человеком и домашними животными, а также сокращения лесов в результате пожаров и рубок.
Бурый медведь впадает в зимний сон, длящийся 5-7 месяцев: с середины октября - середины ноября до середины марта - середины апреля. Активен с 16-18 до 6-9 часов, а иногда, в прохладную погоду, и днем. Гон проходит в мае-июне, рождение детенышей - в январе-феврале. В помете 1-3 детенышей, чаще 2. Самка приносит потомство один раз в два года или даже еще реже.
Тянь-шанский бурый медведь всеяден, в его рацион входят фрукты, ягоды, корни и стебли растений.  Этот медведь не только травояден, но может и напасть намелких млекопитающих – например, сурков и пищух. В парке основным его кормом является  дикая малина, брусника, черный и красный шиповник, плоды яблони, личинки насекомых и кора деревьев. Весной наблюдались случаи поедания сурков и разорения их нор.
На высокх хребтах встречаются следы этого медведя.По информации, полученной посредством фотоловушек, было установлено, что медведи держатся обособленно друг от друга и ходят раздельно. Исключение составляют медведицы с детенышами. Врагами для медвежат являются волк и снежный барс.

Руководитель отдела науки, информации и экологической информации Тюркер З.